各类水利工程建好以后，都要及时建立管理机构，配备专管人员，制定管理办法，加强管理。这是确保水利工程安全，充分发挥水利工程效益的根本措施。

   [管理体制]

  古代，南京市面广量大的水利工程是堤防，对堤防的管理主要是由乡村民众推举地方人士担任圩长，制定乡规民约，进行民间管理。夏季组织防汛排涝，冬季安排岁修堤防，所谓“乡有圩长，岁晏水落，则集丁日具土石楗葘以修圩”。但也有个别重要水利工程，朝庭曾设官方管理机构进行管理。高淳县境内胥溪河上的东坝，关系苏、松地区防洪安全，明洪武二十七年（1394），设东坝巡检司广通镇官署。永乐元年（1403），改筑土坝，增设官吏，“岁佥溧阳、溧水人夫各四十看守”。正统六年（1441）重筑东坝后，制定管理制度，“钦降板榜，如有走泄水利，淹没苏松田禾者，坝官吏处斩，夫匠充军”。民国时期，各类水利工程仍然沿用“自建、自用、自管”的民间管理体制。

  解放以后，随着建成的水利工程越来越多，规模越来越大，以工程为单位成立了许多国家和集体管理的工程管理机构。1957年下关浦口沉排护岸工程竣工后，成立南京市下关浦口护岸工程养护管理所（今南京市长江河道管理处），是南京市第一个市级国家管理的水利工程管理单位。50～60年代，大力兴建水库和发展机电排灌工程时，凡是以国家投资为主建成的水库和机电排灌站工程，以工程为单位成立国家管理机构，以集体投资为主建成的水库和机电排灌站成立集体管理机构，国家管理机构属区县水利部门领导，全民所有制，集体管理机构属乡镇政府领导，集体所有制。70年代，大江大河治理中，建成的水利枢纽工程，均以工程为单位建立工程管理机构，属区县水利局领导，全民所有制。1986年，南京市人民政府颁发《南京市水利工程管理实施办法》，对管理体制作了明确的规定：各类水利工程都要实行统一管理与分级管理相结合，专业管理与群众管理相结合的管理体制，都要建立管理机构，配备管理人员，制定管理规章制度。长江南京河段、滁河马汊河、新、老秦淮河（含句容河、溧水河）以市水利部门管理为主，所在区县配合。滁河、水阳江、石臼湖、固城湖，市委托所在区县水利部门管理。大江大河大湖上的水闸及水利枢纽工程（秦淮河上武定门和秦淮新河闸除外）市委托所在区县水利部门管理。受益和影响范围跨区县的涵闸、水库、排灌站等水利工程，市委托所在区县水利部门管理。受益和影响范围跨乡镇的水利工程由区县水利部门负责管理。不跨乡镇的水利工程由乡镇负责管理。据1997年统计，南京市已成立水利工程管理单位194个，其中市级3个，区县73个，乡镇级118个。在194个管理机构中，属全民所有制质47个，集体所有制147个。

  [河道管理]

  南京市境内的120多条大小河道实行市、区、县、乡镇三级管理，市管理长江南京河段、滁河、秦淮河、水阳江及固城湖、石臼湖等流域性大江大河；区县管理跨乡镇或跨区县的区域性河道；乡镇管理本乡镇范围内的沟河。1957年长江下关浦口沉排护岸工程竣工后，成立南京市下关浦口护岸工程养护管理所，1988年中华人民共和国河道管理条例颁发后，更名为南京市长江河道管理处，隶属南京市水利局领导。1980年秦淮新河分洪道工程竣工后，经江苏省编制委员会批准，成立南京市秦淮河河道堤防管理处，隶属南京市水利局领导。1990年滁河马汊河分洪道工程竣工后，经南京市编制委员会批准，成立南京市滁河管理处，隶属南京市水利局领导。80年代后期至90年代，江浦县成立滁河、长江管理所，江宁县成立河道堤防管理所，雨花台、栖霞、浦口区成立堤防管理所，分别隶属所在区县水利局领导，六合县县管河道由河道上的中型水闸管理所负责管理，高淳、溧水两县县管河道由县水利局直接管理。乡镇范围内的沟河由乡镇水利站管理。

  河道管理范围是护堤地、堤防、两岸堤防间的江河滩地、洲地、穿堤水工建筑物、跨河水工建筑物等。河道管理的内容有：定期巡查河道堤防工程现状，特别是汛期和枯水季节要加强巡查。长江南京河段每年要定期进行水下地形测量，及时掌握河床冲淤变化。穿堤涵洞每年冬季枯水时期，要抽干水进洞检查有没有发生沉陷断裂等异常情况。每年春秋两季，要沿堤防迎、背水坡查找白蚁活动迹象。每次检查，都要做好记录，建立档案。每日定时观测雨量、水位、流量等水文资料，及时报送各级防汛防旱指挥部。编报岁修和除险加固工程，不断提高抗灾能力。审查在河道管理范围内开发利用水土资源，兴建各类建筑物工程项目。1985年以后，国家、省、市人民代表大会和人民政府颁发许多水利法规文件，规定凡在河道管理范围内开发利用水土资源，兴建各类建筑物工程，必须经河道管理部门审查批准。程序是：建设单位和个人首先要向河道管理部门提出申请，并提供可行性研究报告，批准立项的文件，有关设计图纸等资料，河道管理部门调查研究后，提出初审意见报同级水行政主管部门审查批准。查处违章事件，大力清除违章建筑和行洪障碍。申领河道管理范围内土地和水面使用权证。收取河道维护管理费。利用水土资源开展综合经营。

  [水库管理]

  南京市境内252座中小型水库，实行区县和乡镇两级管理。13座中型水库和六合县三友、江浦县三岔、溧水县无想寺3座小(一)水库分别以库为单位成立水库管理所进行管理，隶属所在区县水利局领导，小(一)水库也以库为单位成立水库管理所进行管理，隶属乡镇水利站领导。小(二)水库配备2～4名专职管理人员，由乡镇水利站统一管理。

  为了加强水库用水管理，中型水库和部分小(一)水库实行专业管理与群众管理相结合的管理体制，建立水库管理委员会，由水库管理所负责人和受益乡村选派的负责人组成，每年定期召开会议，讨论全年用水分配方案，制定渠道及其配套建筑物维修计划。

  水库管理的主要内容是：经常检查养护水库各项工程设施，特别是溢洪闸和涵洞的启闭设备，每年汛前一定要全面进行保养，保持完好状态。定时观测雨量，水库水位、测压管水位、大坝沉降等水文和工程资料，及时向防汛部门报送。按照水库安全渡汛方案和用水计划，及时做好控制运用，汛期水库蓄水位，不得超过防汛部门批准的汛期控制蓄水位。编报岁修和除险加固工程计划，组织实施岁修和除险加固工程。加强大坝白蚁防治。征收水费。搞好以水库养鱼为中心的综合经营。申领水库管理范围内土地和水面使用权证。

  [机电排灌管理]

  60～70年代，兴建的机电排灌工程，国家投资较多，建成后以乡镇或以站为单位成立国营机电排灌管理站进行管理，隶属区县水利部门领导，70年代后期至80年代，机电排灌全面普及，兴建机电排灌工程的资金实行市、区县、乡镇，受益农户都拿一点的政策，管理体制开始变化，下放很多国营机电排灌站给乡镇，由全民管理变成集体管理。南京市现有3435座固定机电排灌站以乡镇村管理为主。部分小型站已实施小型农田水利工程产权制度改革。大型翻水站由水利枢纽管理处统一管理。骨干抗旱翻水线以线为单位成立管理所，大部分隶属区县水利部门领导，部分隶属乡镇政府或乡镇水利站领导。

  为了加强用水管理，部分骨干抗旱翻水线实行专业管理与群众管理相结合的管理体制，建立用水管理委员会，由管理所负责人和用水单位选派人员组成，定期召开会议，制定用水和渠道维修计划。
机电排灌管理的主要内容是：定期检查机电设备完好情况，每年冬春季要对机、泵、管设备全面进行一次清洗、刷漆和加润滑油。按照用水计划，及时做好控制运用，检查用水情况。编制维修计划，组织实施维修工程。征收水费。充分利用人才、设备开展综合经营。

  [水闸管理]

  60年代起，在治理大江大河时，已建成的14座大中型水闸，并与船闸、翻水站在一起构成水利枢纽工程。各级水利部门对水闸管理比较重视，工程竣工后，就成立水闸管理所（处）。秦淮河武定门、秦淮新河闸管理处，隶属省水利厅领导，六合县三岔湾闸管理处应属省水利厅领导，后来省委托南京市管理、南京市委托六合县水利局管理。其它11座大中型水闸管理所（处）分别隶属所在区县水利部门领导。

  水闸管理的主要内容：定期检查工程和设备完好情况，每年冬春季，对启闭闸门设备进行一次全面清洗、刷添、换油保养。观测雨量、水位、流量等水文资料。按照河道安全渡汛方案，及时做好控制运用，六合县三岔湾闸、溧水县天生桥闸、高淳县杨家湾闸的控制运用，除了服从县防汛部门指令外，还要服从江苏省和南京市防汛部门的指令。编报岁修和除险加固工程计划，组织实施岁修和除险加固工程。征收过闸水费。开展综合经营