水是生命之源，是人类生存和发展的重要物质保障，水路变迁记载着南京的历史。近年来，南京市各级领导一直关注南京市的水环境治理问题，在科学发展观思想指导下，市领导发出了三年治水动员令，以期通过几年的努力，使城市水环境有明显的改善，让南京建设成为“经济发展更具活力，文化特色更加鲜明，人居环境更加优美，社会更加和谐安定”的现代化国际性人文绿都。“十一五”期间，将加快重要河道和湖泊水系的环境治理与生态建设。
　　南京主城水系处于长江与秦淮水系交汇区，其中秦淮河水系流域面积2631平方公里，河道呈树枝状分布，汛期流域汇水相遇，河道纳洪陡急而泻洪不畅。为防洪排涝及农业灌溉的需要，流域性河道及城区内河多处设闸控制，加剧了城区水系水流不畅。城区内河及内湖水质均为劣五类水质，以有机污染及富营养化为特征。随着城市社会经济的发展及城市的急剧扩张，南京市主城水系水质受到严重污染。现存主要问题有三：
　　（1）水源地单一，布局不合理，城市供水安全保障体系薄弱
　　南京城区水源地均来自长江，其中主要的供水水源地南京夹江段梅子洲头至梅子洲尾全长12.6公里，承担着主城3/4的供水任务。目前，城市化的快速发展使得外江水源地被城市圈和化工园区所包围，水源地取水口与排污口交错分布，城北水厂取水口两侧均有小码头污染，违章建筑物处处可见，工业企业废污水排放量大，水源地水质受到污染，且有加剧之势。据长江南京段水质监测结果显示，长江中污染物平均超标率石油类达60％，大肠菌群达40％，有机化合物多达468种，其中37种为美国EPA优先控制污染物，25种为我国68种环境优先控制污染物名单物质，检出率大于50%的检出物有23种。水污染已成为影响南京饮用水水源地安全的首要问题。
　　近几年，沿江开发也给南京城市供水安全带来了巨大的压力，沿江分布的化工企业，以及有毒有害物质的运输、储存等，皆有可能因发生事故而造成化学品、油品泄漏，这都是水源地突发性水污染事故的潜在隐患。万一发生类似于松花江和广东北江的污染事故，在短时间内将会给城区供水带来极大的困难。因此，城市供水安全保障体系建设亟待加强，主城区的备用水源地（如地下水厂），必须加以论证与实施。
　　（2）城市水环境污染严重，调水释污仅为权宜之计，成本过高
　　秦淮河是南京的“母亲河”、“文化河”，然而近年来由于社会经济的不断发展，水环境污染日趋严重。2002年底，市政府对外秦淮河武定门至三汊河入江口段(12.5公里)进行全面整治,在秦淮河两岸基本形成“一带、二廊、五片、八景”的景观格局，但是，局部工程的实施并不能根本解决秦淮河的污染问题。据2001-2005年的水质监测资料显示表明，外秦淮河水质较差，市区凤台桥段水质一直是劣于五类水，内秦淮河水质近两年有所改善，主要超标物为氨氮，超标量为1.6倍。
　　引长江水对秦淮河进行释污是目前改善秦淮河水环境质量的主要措施之一。但由于河道受区域汇水纳污的影响，调水一旦停止或冲污量减少，水体水质很快变劣。南京市从2005年7月份开始调水释污，除十运会期间，因从长江向秦淮河调入2.1亿方水量，使得外秦淮河水质有了较为明显的改善，水质达到四至五类水外，其余时间均在五类水及以下。尤其是调水停止以后，秦淮河水质很快变差，继续劣于五类水。究其原因，一是截污不到位，尤其在降雨初期，雨污混流直排秦淮河，造成污染；二是洪季调水水源地石臼湖水质近年呈下降趋势，途经地区湖水及江水不断受污染，到达城区河段时往往五类水的标准都达不到。
　　此外，调水释污成本较高。研究表明，若要保持秦淮河良好的景观水标准，丰水期除从石臼湖自流引水外，还需从长江引水5.0亿方，其中一段时间还需翻水0.3亿方；枯水期需从长江翻水2.3亿方。若按照0.12元每方的调水成本估算，每年的调水费用高达3100多万元人民币。如遇重大活动，更需加大调水量。
　　事实上，调水释污改善秦淮河水环境仅是权宜之计，它不可能成为长期采用的水污染控制措施，引水释污并不能对污染物进行有效地削减，同时污染物的迁移还会侵占下游水体的环境容量。引水改善水环境的影响范围是局部的，时效也是短暂的。
　　（3）水务管理职能分散、无法形成合力
　　目前南京市水环境管理沿用的是分部门的“分割式”管理体制，如水利部门、环保部门及市政部门分头管理，这种“多龙管水，多龙治水”的管理体制，人为造成了“水流成线，各管一段，同一水体，分属各家”的水环境管理分割局面，形成“管水源的不管供水，管供水的不管排水，管排水的不管治污，管治污的不管污水回用”的格局，导致流域水环境管理部门职能交叉，投资分散，无法形成合力的局面，这在一定程度上制约了流域水环境的有效治理。
　　要彻底改善南京市水环境质量，我们建议：
　　第一，必须从源头抓起、从流域的角度系统考虑，由南京市人民政府牵头，尽快着手对南京市江河水系水环境治理进行系统研究，将控污、调水和生态治理进行三位一体的综合考虑，从根本上改变依赖调水的状况。通过补源、控源及流域水循环调控等技术，改善南京市水环境质量，将南京建设成为生态型城市。
　　第二，科学规划，合理布局。建议政府进行取水口整治，制订具体的取水口整治方案，取水口要布局在岸线比较稳定、上游没有污染、不产生严重淤积的畅流河段，沿岸不得设立有害化学物品仓库、堆站或装卸垃圾、粪便和有毒物品的码头。所有列入整治方案的项目要明确责任部门、明确经费渠道、明确时间表、明确考核办法。　　第三，制定应急供水预案，建立备用水源。通过水源地风险预警、安全保障体系的研究，制定应急供水预案，完善应急管理系统。我们认为，丰富应急手段、完善应急预案中必须加入开发不同水系的后备水源地建设的内容，松花江流域水质污染造成哈尔滨市全市停水的教训在这方面已经给我们敲响了警钟，所以应坚持常规水源和储备水源相结合。南京有着丰富的地下水资源，除长江以外的备用水源地，可以考虑利用地下水，“地下水作为一种资源，不能盲目开采，当然也不能‘因噎废食’”，可以通过地球物理勘探，选择可行位置进行打井取水，建立一个地下水厂，日取水量在30－40万吨，作为地表饮用水水源地一旦受到突发性事故污染的应急备用水源。但在采用地下水源时，应注意采补平衡，必要时可辅以相应的补源措施。
　　第四，强化监管，通过政策、法规及管理机制的完善，保证南京市城市水环境质量的可持续改善。一是健全监管制度，明确责任部门的职责，采取持久有效的监管办法，严厉打击污染环境和破坏生态的违法行为；二是建立环境行为信息公开化制度，环保部门应当定期向社会公布城区水系及饮用水水源保护区水质情况，公布重点排污单位排污状况，发动公众参与监管，畅通举报渠道，对举报有功个人给予奖励；三是加大处罚力度。针对目前整个南京市水环境保护工作中缺乏有效统一管理的现状，我们建议在全市范围内成立水务管理的专门机构，对包括水环境保护工作在内的涉水事务施行统一管理、统一监控、统一利用。
　　总之，水环境保护是一项长期的、艰巨的工作，是全社会共同的责任，我们需以“预防为主、防治结合、标本兼治、综合治理”为基本方针，加大水环境治理力度，推进南京生态市建设。我们相信，南京市水环境在高效地统一管理、有效地控污治理、良好的生态构建这三个方面综合同步实施下，一定可以达到可持续利用的目标，使南京人民认可和放心。